Introdução: Embora o exercício físico (EF) regular seja recomendado para tratar a obesidade, a abordagem fisioterapêutica quanto ao tipo de exercício para melhorar a saúde e reduzir o risco cardiometabólico em indivíduos obesos não está totalmente clara. Objetivo: Avaliar os efeitos de diferentes protocolos de tratamento, baseados na intervenção com EF, sobre a perda de peso, alterações de índices antropométricos e cardiometabólicos, e medidas de composição corporal em indivíduos obesos. Métodos: Realizou-se pesquisa nas bases de dados PubMed, Scopus, Web of Science e Embase nos últimos cinco anos. Foram considerados ensaios clínicos randomizados comparando diferentes intervenções, que envolvessem EF, conduzidos em seres humanos e na língua inglesa. As intervenções com exercícios precisavam ter como objetivo a melhora de variáveis de composição corporal, antropometria e índices cardiometabólicos. Utilizou-se a escala PEDro para avaliar a qualidade dos estudos elegíveis. Resultados: A busca resultou em 2.237 documentos, sendo que, após as exclusões dos artigos duplicados e revisão do texto completo, foram incluídos 9 estudos. Três estudos foram de alta qualidade (?6) e 6 estudos foram de baixa qualidade (<6). Os protocolos de exercício dos estudos incluídos basearam-se em treinamentos resistidos, aeróbios ou combinados, e variaram quanto à intensidade e tipo (contínuo ou intervalado; em circuito ou em série), duração da intervenção e associação ou não à dieta/fármaco/ suplemento. Conclusão: Protocolos de treinamento combinado, treinamento intervalado de alta intensidade (TIAI) e treinamento resistido intervalado (TRI) mostraram bons resultados na perda de peso e na melhora do perfil de variáveis/índices bioquímicos. Tais achados devem ser considerados com cautela devido a qualidade metodológica dos estudos.